完美体育和数明小讲堂 | 新冠核酸检测之PCR技术
疫情防控
科(kē)学防(fáng)疫 数(shù)明有(yǒu)“芯”
当前(qián)上(shàng)海(hǎi)正(zhèng)处于抗(kàng)新型冠(guàn)状病毒肺(fèi)炎疫情防控的关(guān)键(jiàn)阶段,在这个没有硝烟的战场上,及时快(kuài)速地筛查新(xīn)冠感染者并(bìng)及时进(jìn)行隔离是阻止新冠病毒肆意蔓延的最有效且唯一的(de)手段。核(hé)酸检测是目前筛查新冠感染者最精准(zhǔn)、有(yǒu)效、低成(chéng)本的技术方式。
什么(me)是PCR?
聚合酶链式反(fǎn)应(Polymerase Chain Reaction), 简称(chēng)PCR, 又称多聚(jù)酶(méi)链(liàn)式反应,是一项利用DNA双链复制(zhì)的原理,在生(shēng)物体(tǐ)外复制(zhì)特(tè)定DNA片段的核酸合成技(jì)术。透过这(zhè)项(xiàng)技术,可(kě)在短时间内大量扩增目的(de)基(jī)因,而不必依赖大肠杆菌或(huò)酵母(mǔ)菌等(děng)生物体(tǐ)。
PCR扩增的三(sān)个基本步骤
(1)变性:模(mó)板DNA经加(jiā)热至(zhì)94℃左右并保持一定(dìng)时(shí)间后,基于(yú)DNA半保(bǎo)留复制原(yuán)理,还有碱基互(hù)补配对原则,即复制的过程中双链DNA会解链,由双(shuāng)链变成单链,为下(xià)轮反应(yīng)做准备;
(2)退火:模(mó)板DNA经(jīng)加(jiā)热变性成单链后,温度(dù)降至55℃左右,引物与(yǔ)模板DNA单(dān)链的(de)互补序列配对结合(hé);
(3)延(yán)伸(shēn):温(wēn)度再升至72℃左右,在DNA聚合酶的作用(yòng)下(xià),把游离的(de)dNTP按照碱基(jī)互(hù)补配对原(yuán)则结合到单链上,形成一条由旧链和新(xīn)链杂合成的新的双链(liàn)DNA。
PCR扩增原(yuán)理:变形-退火-延伸(shēn)温度循环
理论上,经过上面步骤,目标DNA浓度可增(zēng)加一倍。重复循环(huán)上述过程,可获得更多的“半保留复制(zhì)链”,而(ér)形成的新(xīn)链又可成为下(xià)次循环的(de)模板。每(měi)完成一个循环需2~4分钟, 仅(jǐn)需2~3小时(shí)就能将目标DNA扩增放(fàng)大几百(bǎi)万倍。
全自动核酸提纯及实时荧光PCR分析(xī)系统
经过以上(shàng)分析,我们就(jiù)可以理解为什么核(hé)酸检(jiǎn)测结(jié)果最快(kuài)能(néng)在几个小时(shí)内(nèi)出(chū)结果。
实时荧光PCR定量分析
PCR扩增仪温度(dù)控制指标主要有:温度的准确性、均匀性、以(yǐ)及升降(jiàng)温速度。
1. 温度(dù)的准确性:是(shì)指样品孔温度与设定温度(dù)的一致性,它直接关系到实验的成(chéng)败。因而对PCR扩增仪而言(yán)温度控(kòng)制就意味着(zhe)产(chǎn)品质量(liàng)。
2. 温度(dù)的均匀性:是指样品孔(kǒng)间的温(wēn)度差异,它关系到在不同(tóng)样(yàng)品孔进行反应结果(guǒ)的(de)一致(zhì)性。
3. 升降温速度:更快的升降温速度,可(kě)以有(yǒu)效缩短(duǎn)反(fǎn)应时间和可(kě)能的非特(tè)异性结合、反应的时间,从(cóng)而提高PCR反(fǎn)应特异性。
相较于传统(tǒng)的相对稳定耐用的机械式,新的半导体温(wēn)控技术(shù)——TEC温度(dù)控制技(jì)术(shù)具有升降温(wēn)更快(kuài)速(sù)的优势,已(yǐ)经成为PCR扩增仪的首(shǒu)选温度控制技术。
半导体制冷器(qì) (Thermo Electric Cooler,简称 TEC) 是利用半导体(tǐ)材料的帕尔贴效应制成的。如图下所示,帕尔(ěr)帖效应是(shì)指当(dāng)直流电流通过两种半导体材料组成的电偶时,其一端吸热(rè),一端放热的现(xiàn)象。TEC 包括一些 P 型和 N 型对(组),它们通(tōng)过电极连在一起,并(bìng)且夹在两个陶瓷电极之间(jiān),当有电(diàn)流从 TEC 流过(guò)时,电流产(chǎn)生的热量(liàng)会从 TEC 的 一侧传到另一侧,在(zài) TEC 上产生″热(rè)″侧和″冷″侧,这就是 TEC 的加热与致冷原理。
帕尔(ěr)帖效应,PN 节(jiē)以及(jí)热流动示意(yì)图
PCR扩(kuò)增仪(yí)一般具有(yǒu)两种温控模式,即模块温控模式(Block-control)和反应管温控模(mó)式(tube-control)。管内样品的温度(dù)无法与(yǔ)温(wēn)控模块同时达到预(yù)设温度,特(tè)别是(shì)PCR反应中(zhōng)的孵育过程(chéng)一般为30秒或更短,如果采用(yòng)只(zhī)有模块温控模式的话,反应混合(hé)物孵(fū)育的时间(jiān)与程序设定(dìng)的时间(jiān)会有相当大的差距。为了达到反应管内(nèi)部温度精确(què)控制(zhì),需(xū)采(cǎi)用反应管控制模模式,通过温(wēn)度控制算法(fǎ)进行参数标定(dìng)和补偿,确保反应混合物按照程序设定的时间维持预设(shè)温度。
科技战“疫”,完美体育和数明在行动
面对近期香(xiāng)港(gǎng)、深圳、上(shàng)海等地(dì)奥(ào)密(mì)克(kè)戎的(de)快速(sù)扩散,核酸检测能(néng)力在数量和速度方面都面(miàn)临着极大的考验(yàn)。完美体育和数明半导体积极发挥了科技技术方(fāng)面的(de)优势,组织技(jì)术专家研究PCR扩增技(jì)术的优化解决方案,以(yǐ)功率器件门(mén)极驱动芯片和TEC控制器为着力点,优(yōu)先保障芯片供应和(hé)交(jiāo)付,与客户一起助力抗疫,共克时(shí)艰。
完美体育和数明(míng)半导体自研的20V-600V耐压全系列的低边、半桥(qiáo)、三相半桥等功率管门极驱动芯片(SLM2103S、SLM2136等)可用于(yú)驱动TEC,协助PCR扩(kuò)增仪器(qì)客(kè)户快速、方便(biàn)地完成系统设计,在当前半导体供应短(duǎn)缺时期,可(kě)以满足客户设计方案的快速变更、验证与量产。
600V耐(nài)压半桥(qiáo)功率器件驱动(dòng)芯(xīn)片工作(zuò)示意图
600V耐压(yā)三相半桥功率器件驱动芯片工(gōng)作示意图
数(shù)明半(bàn)导体的单芯片TEC控制器产品——SLM8833/8834/8835 集成了(le)TEC驱动(dòng)电路、低(dī)温飘(piāo)高精度温(wēn)度误差放大器及(jí)环路补偿电路、温度设定与传感(gǎn)电路,采用高效的单电感(gǎn)架构,实现更紧凑(còu)、更高(gāo)的转换效率及更低的噪声;其(qí)中功率级(jí)集(jí)成(chéng)了超低阻抗(kàng)的MOSFET,损耗更低寿命(mìng)更久(jiǔ);同时匹配模(mó)拟PID与数字PID两种温控模式,以(yǐ)满足客户PCR扩增(zēng)仪的小型化(huà)创新设计需求。
由SLM8834 构(gòu)成的 TEC 系统框图
模拟PID温控器(qì)模式
数字PID温(wēn)控模式